Обладая незаурядной эрудицией в области народного песенного и инструментального творчества, Иса Байзаков был не только участником создания первых музыкальных спектаклей, но и их исполнителем. Многие его песни вошли в оперы «Айман–Шолпан», «Кыз–Жибек», «Ер–таргын». И, в связи с этим хочется особенно отметить, что напетая им народная песня «Гакку» вошла в оперу «Кыз–Жибек» и стала самой популярной казахской песней в Советском Союзе.
В 1931–1940 годах Иса Байзаков работает на Казахском радио, где под аккомпанемент домбры исполняет свои и другие народные песни. В эти же годы он становится членом Союза писателей Казахстана.
В 1936–1937 годах семья Байзаковых проживает в г. Семей. Но одно горе за другим приходило в семью Исы. Умерла маленькая дочь Жулдыз. Затем совсем слегла Шарбану и трагически уходит в апреле 1937 года. После этого Иса с двумя детьми возвращается в
г. Алма–Аты, где, следуя наставлениям Шарбану, он отдает своих детей в музыкально–хореографическую школу–интернат, которая позже стала носить имя его друга – великого певца Амре Кашаубаева. Младшего сына Иртыса определяют в музыкальную группу, а дочь Махпузу – в хореографическую, и после ее завершения она идет работать в Казахский театр оперы и балета им. Абая, в балетную труппу.
Несмотря на тяжелую утрату, Иса продолжает свое творчество, выступает с концертами, творит.
Когда началась Великая Отечественная война, Иса захотел отправиться на фронт добровольцем, но из-за слабого здоровья ему было отказано. Голодные годы, изнурительная работа, а также зачастую отсутствие комфортных условий для жизни подорвали его здоровье еще с молодости. Вместо этого Иса начал собирать средства на нужды фронта, выступая с концертами по всей стране. За годы войны эта сумма составила более миллиона рублей.
Но даже в эти тяжёлые времена он не отступил от искусства – продолжал сочинять, выступать, творить. Без лишней звуковой аппаратуры, и других доступных сегодня технологий, он собирал сотни слушателей по всему Казахстану. И там, перед народом, он часами рассказывал о любви и мужестве, пел о том, что происходит на фронте, вдохновлял и давал людям надежду, что их близкие вернутся с победой. Он выступал с импровизацией о героях Тулегене Тохтарове, Малике Габдуллине и о других воинах, героически сражающихся на фронтах. Люди верили Исе. Его поэзия и музыка обладали силой говорить о сложном простыми словами, понятными каждому.
Иса Байзаков оставил богатое литературное наследие. Он – автор ряда эпических произведений, сложенных на основе казахского фольклора: «Красавица Куралай» (1925), «Сказка пастуха» (1926), «В предгорьях Алтая» (1934), «Қырмызы Жанай» (1940), «Кавказ» (1939), «Ақбөпе» (1941). В них воспеты идеалы гуманизма, добра и справедливости.
А по-своему идейно–художественному достоинству они вошли в золотой фонд казахской поэзии.
Любовь к родной земле, её природе и людям стала главной темой его поэзии. Он поднимал и социальные вопросы: осуждал несправедливость, социальное неравенство, пережитки прошлого, включая насильственные браки. Эта традиция была настолько сурова, что нередко приводила к трагедиям. Иса с глубокой болью описывал в своих стихах и поэмах разбитые сердца влюблённых, их трагические судьбы, чтобы объяснить, показать и научить. Он защищал право на свободную любовь.